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Kirkstall串聯(lián)器官芯片攜手傳統(tǒng)毒理基因組學(xué)?

來源:北京基爾比生物科技有限公司   2025年04月21日 19:43  

1. 背景研究:傳統(tǒng)毒理學(xué)的局限性與動物實驗的挑戰(zhàn)

1.1 動物模型的科學(xué)局限性  

傳統(tǒng)毒理學(xué)依賴動物實驗(如嚙齒類和非人靈長類)評估化學(xué)物質(zhì)的安全性,但其科學(xué)有效性面臨多重質(zhì)疑。種間差異是核心問題:例如,小鼠肝臟代謝通路與人類存在顯著差異,導(dǎo)致約60%的肝毒性藥物在動物試驗中未能預(yù)測人體反應(yīng)(如曲格列酮事件)。此外,動物模型難以模擬復(fù)雜的人類疾病表型(如神經(jīng)退行性疾病或免疫介導(dǎo)的毒性),且短期暴露實驗無法捕捉慢性毒性效應(yīng)。  

1.2 倫理爭議與社會壓力  

“3R原則”(替代、減少、優(yōu)化)自1959年提出后,逐漸成為全球共識。歐盟《化妝品指令》(2013)全面禁止動物實驗,美國EPA曾提出了預(yù)計2035年前淘汰哺乳動物測試。公眾對動物福利的關(guān)注與立法壓力迫使行業(yè)加速尋找替代方案。  

1.3 成本與效率瓶頸  

一項新藥的臨床前毒性測試需耗費約1.5億美元和6年時間,而90%的候選藥物因毒性問題在臨床試驗中失敗。動物實驗的低通量和高成本已成為創(chuàng)新藥開發(fā)的重大障礙。

2. 行業(yè)發(fā)展:類器官與器官芯片的技術(shù)演進與監(jiān)管推動

2.1 類器官技術(shù)的崛起:從二維到三維  

類器官(Organoids)通過干細胞自組織形成微型器官結(jié)構(gòu),保留原組織的細胞異質(zhì)性與功能。例如,肝臟類器官可模擬藥物代謝酶活性,腸類器官能重現(xiàn)腸屏障與免疫反應(yīng)。2013年,Hans Clevers團隊shou ci實現(xiàn)人腸道類器官培養(yǎng),標(biāo)志著技術(shù)進入實用化階段。  

2.2 Kikstall串聯(lián)式器官芯片的多元化應(yīng)用場景  

器官芯片(Organs-on-Chips)通過微流控技術(shù)模擬器官微環(huán)境,如Kirkstall Quasi Vivo 北京基爾比生物公司的“肺芯片” 其核心優(yōu)勢在于:  

- 動態(tài)灌注系統(tǒng):模擬血液流動與營養(yǎng)供給;  

- 多器官串聯(lián):評估全身性毒性(如肝-肺軸相互作用);  

- 實時暴露與監(jiān)測:整合煙霧吸入發(fā)生,PM2.5氣溶膠霧化發(fā)生,臭氧/微塑料等新污染物發(fā)生器,兼容便于檢測代謝物或細胞應(yīng)激標(biāo)志物。  

2.3 全球監(jiān)管框架的轉(zhuǎn)型  

美國EPA通過“新方法學(xué)”(NAMs)戰(zhàn)略,將類器官數(shù)據(jù)納入化學(xué)品風(fēng)險評估。OECD發(fā)布《體外皮膚致敏測試指南》(TG 442E),認可GARDskin等轉(zhuǎn)錄組學(xué)生物標(biāo)志物。2022年,F(xiàn)DA啟動“動物實驗替代計劃”,優(yōu)先審查基于器官芯片的IND申請。 2025年4月10日,F(xiàn)DA發(fā)布的《減少臨床前安全研究中動物測試路線圖》系統(tǒng)性地提出了通過“新方法學(xué)”(NAMs)替代傳統(tǒng)動物實驗的戰(zhàn)略框架。NAMs涵蓋器官芯片、計算機建模(如AI預(yù)測、PBPK模型)、體外人類細胞系統(tǒng)等。


3. dian fu創(chuàng)新:類器官&Kirkstall器官串聯(lián)芯片的技術(shù)突破與毒理學(xué)范式轉(zhuǎn)移

3.1 多器官串聯(lián)與系統(tǒng)性毒性評估  

單一器官模型無法捕捉代謝產(chǎn)物的遠端效應(yīng)。Kirkstall Quasi Vivo類器官3D動態(tài)構(gòu)建系統(tǒng) 通過模塊化設(shè)計連接肺、肝、心、腎等芯片,模擬藥物ADME(吸收、分布、代謝、排泄)過程。例如,某抗癌藥在肝臟代謝后生成的活性代謝物可能對心臟產(chǎn)生毒性,此類系統(tǒng)性效應(yīng)僅能通過多器官串聯(lián)模型檢測。  

3.2 高通量篩選與人工智能驅(qū)動的數(shù)據(jù)分析  

結(jié)合機器人自動化與AI算法,類器官芯片可實現(xiàn)千級化合物/周的測試通量。如DeepMind開發(fā)的毒性預(yù)測模型,通過分析轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)(如TG-GATEs數(shù)據(jù)庫)與器官芯片表型數(shù)據(jù),準(zhǔn)確率比傳統(tǒng)方法提升40%。  

3.3 毒理基因組學(xué)的深度整合  

《Progress in toxicogenomics to protect human health》發(fā)表于《Nature Reviews Genetics》,由Matthew J. Meier等人撰寫,系統(tǒng)回顧了毒理基因組學(xué)(toxicogenomics)在保護人類健康方面的進展。Kirkstall串聯(lián)器官芯片如何<a class=

3.3.1. 毒理基因組學(xué)的定義與目標(biāo)

毒理基因組學(xué)通過測量分子特征(如轉(zhuǎn)錄本、蛋白質(zhì)、代謝物和表觀基因組修飾)來理解和預(yù)測環(huán)境和藥物暴露的毒性效應(yīng)。其目標(biāo)是通過早期、更準(zhǔn)確的毒性預(yù)測,減少對動物實驗的依賴,并提高毒理學(xué)研究的效率和精準(zhǔn)性。

3.3.2. 轉(zhuǎn)錄組學(xué)在毒理學(xué)中的應(yīng)用

轉(zhuǎn)錄組學(xué)已成為毒理基因組學(xué)的核心工具,通過高通量基因表達分析提供機制和定量信息。轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)可用于預(yù)測毒性風(fēng)險,通過轉(zhuǎn)錄組生物標(biāo)志物、網(wǎng)絡(luò)推斷分析、模式匹配方法和人工智能技術(shù)實現(xiàn)。

3.3.3. 實驗方法

毒理基因組學(xué)研究通常涉及在體外或體內(nèi)暴露于不同劑量、暴露時間和組織類型下的轉(zhuǎn)錄組變化。研究設(shè)計基于具體問題,可能需要大樣本量進行成對比較,或在多個處理組中模擬數(shù)據(jù)趨勢(如劑量-反應(yīng))。

3.3.4. 數(shù)據(jù)收集與分析

轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)收集從表達序列標(biāo)簽(EST)發(fā)展到基于雜交的微陣列技術(shù),再到目前廣泛使用的RNA測序(RNA-seq)。數(shù)據(jù)分析從識別差異表達基因(DEGs)開始,常用軟件包括DESeq2、edgeR和limma。此外,還通過基因集富集分析(GSEA)等方法整合DEGs與生物通路,以揭示毒性機制。

3.3.5. 發(fā)現(xiàn)機制與預(yù)測風(fēng)險

路徑和網(wǎng)絡(luò)分析是篩選大型轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)集、識別毒理學(xué)機制和潛在健康影響的強大工具。然而,轉(zhuǎn)錄組變化與毒性結(jié)果之間的復(fù)雜關(guān)系給解釋帶來了挑戰(zhàn)。為此,預(yù)測毒理學(xué)應(yīng)運而生,通過模式匹配方法(如聚類分析和連通性映射)開發(fā)轉(zhuǎn)錄組生物標(biāo)志物,以客觀、高效和可重復(fù)地將分子變化與毒性機制和風(fēng)險聯(lián)系起來。

3.3.6. 轉(zhuǎn)錄組劑量-反應(yīng)建模

傳統(tǒng)的毒理學(xué)通過動物實驗中的臨床和病理終點確定可接受暴露水平(即無不良效應(yīng)的最高劑量,POD)。毒理基因組學(xué)引入了轉(zhuǎn)錄組POD(tPOD),通過短期動物實驗中的轉(zhuǎn)錄組變化來確定POD。研究表明,tPOD與傳統(tǒng)POD之間高度一致,表明轉(zhuǎn)錄組變化可以作為健康保護風(fēng)險評估的有效工具。

3.3.7. 單細胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)

單細胞RNA測序(scRNA-seq)和空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)能夠測量單個細胞的基因表達,揭示細胞類型特異性的轉(zhuǎn)錄組變化。這些技術(shù)在毒理學(xué)中的應(yīng)用尚處于起步階段,但已顯示出在理解細胞類型特異性毒性機制方面的巨大潛力。

3.3.8. 系統(tǒng)毒理學(xué)與多組學(xué)

系統(tǒng)毒理學(xué)通過整合多組學(xué)數(shù)據(jù)(如轉(zhuǎn)錄組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等)來全面表征化學(xué)物質(zhì)引起的分子終點。多組學(xué)方法已在臨床毒理學(xué)和環(huán)境暴露研究中得到應(yīng)用,未來需要解決數(shù)據(jù)整合和解釋的挑戰(zhàn)。

3.3.9. Kikstall Quasi Vivo 串聯(lián)式器官芯片在毒理基因組學(xué)中的應(yīng)用

毒理基因組學(xué)已成為毒理學(xué)研究的核心組成部分,并有望成為現(xiàn)代風(fēng)險評估的基石。盡管轉(zhuǎn)錄組學(xué)尚未wan quan實現(xiàn)其在監(jiān)管測試中的潛力,但其在毒性測試中的應(yīng)用正在向定量劑量-反應(yīng)建模轉(zhuǎn)變,以確定保護健康的暴露限值。

未來,毒理基因組學(xué)有望通過類器官與串聯(lián)式器官芯片,例如Kirkstall Quasi Vivo多器官串聯(lián)培養(yǎng)技術(shù),結(jié)合AI人工智能和機器學(xué)習(xí)技術(shù)在毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)分析中發(fā)揮重要作用提供更深入的毒性效應(yīng)見解,減少毒性測試中所需的動物數(shù)量,并加速對人群健康影響的評估。

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4. 展望未來:Kirkstall Quasi Vivo類器官動態(tài)構(gòu)建系統(tǒng)的創(chuàng)新與應(yīng)用潛力

4.1 Kirkstall Quasi Vivo的技術(shù)優(yōu)勢與設(shè)計哲學(xué): 其設(shè)計哲學(xué)強調(diào)“簡化復(fù)雜性”,通過標(biāo)準(zhǔn)化接口降低用戶操作門檻。  

- 模塊化流體網(wǎng)絡(luò):獨立腔室通過生物相容性管道連接,支持定制化器官組合;  

- 生理剪切應(yīng)力:模擬真實血流動力學(xué),維持細胞功能;  

- 長期培養(yǎng)穩(wěn)定性:適合慢性毒性研究。  


4.2 應(yīng)用案例:從藥物開發(fā)到環(huán)境毒理  

- 藥物肝毒性評估:某制藥公司使用肝-心臟串聯(lián)芯片,發(fā)現(xiàn)候選藥物代謝產(chǎn)物引發(fā)QT間期延長,提前終止開發(fā),節(jié)約成本2億美元;  

- 納米材料安全性測試:Quasi Vivo模擬肺泡-肝軸,揭示碳納米管通過氧化應(yīng)激誘發(fā)肝纖維化,補充傳統(tǒng)動物實驗的盲點;  

- 個性化醫(yī)療:結(jié)合患者來源類器官,預(yù)測個體化化療方案的骨髓抑制風(fēng)險。  

5. 結(jié)論:從補充—替代到超越——毒理學(xué)的未來圖景

Kirkstall Quasi Vivo類器官串聯(lián)芯片培養(yǎng)微生理系統(tǒng)等“新方法學(xué)”(NAMs)不僅是動物實驗的補充或替代方案,更是毒理學(xué)范式的革命。通過整合多組學(xué)、微生理系統(tǒng)與AI,未來毒理學(xué)將實現(xiàn):  

- 精準(zhǔn)預(yù)測:基于機制的多層次毒性評估;  

- 動態(tài)監(jiān)測:實時追蹤毒性演化的時空軌跡;  

- 全局優(yōu)化:從分子到生態(tài)系統(tǒng)的全鏈條安全設(shè)計。  


隨著監(jiān)管壁壘的突破與技術(shù)成本的下降,類器官技術(shù)的更加完善,一個“人體體外重建”的新時代即將來臨,不久的將來,Kirkstall Quasi Vivo類器官串聯(lián)芯片系統(tǒng)等“新方法學(xué)”(NAMs)有望成為毒理測試的黃金標(biāo)準(zhǔn),最終實現(xiàn)“零動物實驗”的愿景。


北京基爾比生物公司主營產(chǎn)品:

Kilby 3D-clinostat 三維旋轉(zhuǎn)儀,

Kilby 微/超重力三維細胞培養(yǎng)系統(tǒng),

3D回轉(zhuǎn)重力環(huán)境模擬系統(tǒng),隨機定位儀,

類器官芯片搖擺灌注儀,

Kirkstall 類器官串聯(lián)芯片灌流仿生構(gòu)建系統(tǒng)



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