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干貨:WB, IHC實(shí)驗(yàn)問題總結(jié)與處理方案

來源:南京億迅生物科技有限公司   2024年07月09日 17:14  

1、western blot 的優(yōu)點(diǎn)

答:靈敏,可達(dá)ng級(jí),用Ecl顯色法理論上可達(dá)pg 級(jí)。方便,特異性高。


2、為什么我的細(xì)胞提取液中沒有目標(biāo)蛋白?

答:原因有很多:

a) 你的細(xì)胞中不表達(dá)這種蛋白質(zhì),換一種細(xì)胞;

b) 你的細(xì)胞中的蛋白質(zhì)被降解掉了,你必須加入PMSF,抑制蛋白酶活性;

c) 你的抗體不能識(shí)別目標(biāo)蛋白,多看看說明,看是否有問題。


3、我的細(xì)胞提取液有的有沉淀,有的很清亮,為什么呢?

答:a) 有沉淀可能因?yàn)槟愕牡鞍讻]有變性完,可以適當(dāng)提高SDS 濃度,同時(shí)將樣品煮沸時(shí)間延長(zhǎng), b) 也不排除你的抗原濃度過高,這時(shí)再加入適量上樣緩沖液即可。


4、我做的蛋白質(zhì)分子量很小(10KD),請(qǐng)問怎么做WB?

答:可以選擇0.2μml的膜,同時(shí)縮短轉(zhuǎn)移時(shí)間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉(zhuǎn)移。其他按步驟即可。


5、我的目的帶很弱,怎么加強(qiáng)?

答:可以加大抗原上樣量。這是最主要的。同時(shí)也可以將一抗稀釋比例降低。


6、膠片背景很臟,有什么解決方法?

答:減少抗原上樣量,降低一抗?jié)舛?,改變一抗孵育時(shí)間,提高牛奶濃度。


7、目標(biāo)帶是空白,周圍有背景,是為什么?

答:你的一抗?jié)舛容^高,二抗上HRP 催化活力太強(qiáng),同時(shí)你的顯色底物處于一個(gè)臨界點(diǎn),反應(yīng)時(shí)間不長(zhǎng),將周圍底物催化完,形成了空白即“反亮現(xiàn)象”。將一抗和二抗?jié)舛冉档?,或更換新底物。


8、我的膠片是一片空白,是怎么回事?

答:如果能夠排除下面的幾個(gè)問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。

a) 二抗的HRP 活性太強(qiáng),將底物消耗光;

b) ECM底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;

c) ECL底物沒覆蓋到相應(yīng)位置;

d) 二抗失活。


9、我在顯影液中顯影1分鐘和5分鐘后,底片漆黑一片,是什么原因呢?

答:a) 可能是紅燈造成的, 膠片本來就被曝光了,可以在黑暗的情況下操作.看是否有改善.;b) 顯影時(shí)間過長(zhǎng)。


10、DAB好還是ECM好?

答:DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;ECM結(jié)果容易控制,但被催化時(shí)靈敏度差一點(diǎn),但如果達(dá)到閥值,就特別靈敏,可以檢測(cè)pg 級(jí)抗原。要看你實(shí)驗(yàn)的情況。


11、抗原檢測(cè)出的分子量比資料上的大,是怎么回事?

答:a)抗原形成了二聚體。增多巰基乙醇量,煮沸變性時(shí)間延長(zhǎng),可以打開二聚體。b)蛋白本身的修飾如:糖基化,磷酸化等。


12、蛋白轉(zhuǎn)移不到膜上,但膠上有,同時(shí)Marker 轉(zhuǎn)上去了,為什么?

答:可能是:a)樣品濃度過低;b)轉(zhuǎn)移時(shí)間不夠。


13、磷酸化抗體的檢測(cè)樣本制備時(shí)是否一定要加NaF等?

答:NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑,一般最好加。但是不加也可以,大部分時(shí)候是不用加的。


14、要驗(yàn)證某個(gè)細(xì)胞上有無該蛋白的存在,需要做免疫組化和western blot試驗(yàn)嗎?做這兩個(gè)試驗(yàn)時(shí)的一抗和二抗可以共用嗎?

答:① 免疫組化可以用來進(jìn)行定位,但是不能精確定量,而且有時(shí)會(huì)有假陽性,不易與背景區(qū)分;Western blot可以特異性檢測(cè)某個(gè)蛋白質(zhì)分子,進(jìn)行定量,但是不能定位。

② 兩種實(shí)驗(yàn)的一抗有時(shí)候不能通用,公司的產(chǎn)品說明一般都會(huì)說明可以進(jìn)行什么實(shí)驗(yàn),在免疫組化時(shí),是否適合石蠟切片或者冰凍切片。


15、做Western Blot時(shí),提取蛋白后凍存(未加蛋白酶抑制劑),用的博士德的一抗,開始還有點(diǎn)痕跡,現(xiàn)在越來越差,上樣量已加到120μg,換了個(gè)santa cloz的一抗仍不行。是什么原因?蛋白酶抑制劑單加PMSF行嗎?

答:懷疑是樣品問題,可能是:

1,樣品不能反復(fù)凍融;

2,樣品未加蛋白酶抑制劑。同時(shí),建議檢查Western Blot過程, 提高一抗?jié)舛?。?duì)于加蛋白酶抑制劑來說,一般加PMSF就可以了,最好能多加幾種蛋白酶抑制劑。


16、細(xì)胞水平要做western blot,多少細(xì)胞提的蛋白夠做western blot?

答:一般5×10^6就足夠了。


17、同一樣品能同時(shí)提RNA又提蛋白么?這樣對(duì)western blot有無影響?

答:能,沒有問題。


18、同一蛋白樣品能同時(shí)進(jìn)行兩種因子的Western Blot檢測(cè)嗎?

答:當(dāng)然可以,有的甚至可以同時(shí)測(cè)幾十種樣品。


19、如果目標(biāo)蛋白是膜蛋白或是胞漿蛋白,操作需要注意什么?

答:如果是膜蛋白和胞漿蛋白,所用的去垢劑要溫和得多,這時(shí)最好加上NaF去抑制磷酸化酶的活性。


20、我的樣品的蛋白含量很低,每微升不到1微克,但是在轉(zhuǎn)膜時(shí)經(jīng)常會(huì)發(fā)現(xiàn)只有一部分蛋白轉(zhuǎn)到了膜上,就是在轉(zhuǎn)膜后染膠發(fā)現(xiàn)有的孔所有的蛋白條帶都在,只是顏色變淡了,有什么辦法可以解決?

答:你可以加大上樣量,沒有問題,還有轉(zhuǎn)移時(shí)你可以用減少電流延長(zhǎng)時(shí)間,加20%甲醇。

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