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Taq酶在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)細(xì)節(jié)
閱讀:1294 發(fā)布時間:2019-3-291976年Chien分離出熱穩(wěn)定聚合酶,1986年Erlich分離并純化了適于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的Tq熱穩(wěn)定性聚合酶,為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)成為實用技術(shù)奠定了基礎(chǔ),現(xiàn)已用基因重組。日前可用于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的聚合酶有多種:有從水生棲熱菌中提取的Taq酶、從嗜熱棲熱苗中獲得的Taq酶、從Litoralis棲熱球菌中分離的VENT酶、及從酸熱浴硫化裂片苗中分離的Sac酶,而以Taq酶用得廣泛。Taq DNA聚合酶分子量為94kD,75℃時酶比活性為150bs/酶分子,反應(yīng)溫度過高或過低均影響其延伸率,Taq蕾有很高的耐熱穩(wěn)定性。豬elisa試劑盒實驗表明,在92.5℃、95℃、97.5℃時,其半衰期分別為40min、30min和5min。
純化的Taq酶在體外無3'-5'外切酶活性,因而無校正閱讀功能,在擴增過程可引起錯配。錯配堿基的數(shù)量受溫度、Mg2+濃度和循環(huán)次數(shù)的影響。通常,30次循環(huán)Taq酶的錯配率約為0.25%,高于Klenow酶的錯配率。Taq酶在每一次循環(huán)中產(chǎn)生的移碼突變率為1/30000,堿基替換率為1/8000。應(yīng)用低濃度的dNTP(各20μmol/L)、1.5mmol/L的Mg2+濃度、高于55℃的復(fù)性溫度,可提高Taq酶的忠實性,此時的平均錯配率僅為5x10^-6次/(核苷酸*循環(huán))。
Taq酶具有類似于末端轉(zhuǎn)移酶的TdT的活性,可在新生成的雙鏈產(chǎn)物的3'端加上—個堿基,尤其是dATP容易加上。因此,欲將聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)產(chǎn)物克隆到載體上,可以用兩種處理辦法:一是構(gòu)建dT-載體;二是用Klenow酶將3'端的A去掉,即在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)后,先在99℃加熱10min滅活Taq酶,調(diào)整Mg2+濃度至5-10mmol/L,加入1-2U Klenow片段,室溫下作用15-20min,3'端的A即被切去,
以往用Taq酶進行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)擴增,一般只能擴增小于400bp的DNA片段,經(jīng)過對酶的結(jié)構(gòu)與功能的改造,以及聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)方法學(xué)的改進,現(xiàn)已能擴增20kb以上的DNA分于。
Taq酶在聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)反應(yīng)中加入的量也很重要,太少當(dāng)然不好,太多一方面浪費,同時也導(dǎo)致非特異性擴增,通常每lOOμl反應(yīng)液中含1-2.5U Taq酶為好。在0.5-5U范圍內(nèi)確定佳酶濃度。另一個問題是,雖然Taq酶是熱穩(wěn)定性較好的工具酶,也應(yīng)注意在-20℃貯存。