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凝膠遷移或電泳遷移率實(shí)驗(yàn) (electrophoretic mobility shift assay, EMSA)是一種體外研究DNA結(jié)合蛋白(轉(zhuǎn)錄因子)和其相關(guān)的DNA結(jié)合序列(靶標(biāo)基因的啟動(dòng)子序列)相互作用的技術(shù),可用于定性和定量分析。
EMSA,知其所以然!
正如上方實(shí)驗(yàn)示意圖所示, 蛋白質(zhì)可以與核酸探針結(jié)合,電泳時(shí)這種復(fù)合物比無(wú)蛋白結(jié)合的探針在凝膠中泳動(dòng)的速度慢,即表現(xiàn)為相對(duì)滯后。通過競(jìng)爭(zhēng)性對(duì)照組,可以驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)的特異性。
EMSA,難點(diǎn)與痛點(diǎn)
EMSA實(shí)驗(yàn)是很多實(shí)驗(yàn)新手的攔路虎,不僅實(shí)驗(yàn)步驟繁瑣(凝膠電泳,轉(zhuǎn)膜,紫外交聯(lián),信號(hào)檢測(cè)),而且實(shí)驗(yàn)與對(duì)照組較多(通常為5組,標(biāo)記探針、標(biāo)記探針+蛋白、標(biāo)記探針+蛋白+未標(biāo)記探針(特異競(jìng)爭(zhēng)寡核苷酸)、標(biāo)記探針+蛋白+未標(biāo)記突變探針、標(biāo)記探針+蛋白+抗體),經(jīng)過多次測(cè)試優(yōu)化才能獲得理想的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,綜合成本非常高。
突破EMSA,創(chuàng)新的新方法,Nature為您測(cè)試:
作為表觀遺傳學(xué)的專業(yè)解決方案供應(yīng)商,艾美捷科技為您推薦,Epigentek品牌創(chuàng)新推出的通用蛋白-DNA結(jié)合分析試劑盒(比色法):
產(chǎn)品名稱及描述 | 品牌 | 貨號(hào) | 產(chǎn)品說(shuō)明 |
EpiQuik General Protein-DNA Binding Assay Kit | Epigentek | P-2004 | 詳情 |
* 客戶需自行準(zhǔn)備如下材料:[1]生物素標(biāo)記的特異性探針; [2]未標(biāo)記的特異性探針;[3]目標(biāo)蛋白的一抗與HRP-二抗
通用蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合分析試劑盒原理:
通用蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合分析試劑盒(比色),用于測(cè)量核提取物中轉(zhuǎn)錄因子與DNA結(jié)合活性。在實(shí)驗(yàn)中,含有靶向轉(zhuǎn)錄因子的DNA結(jié)合共有序列的生物素標(biāo)記的雙鏈寡核苷酸(寡核苷酸)與結(jié)合試驗(yàn)緩沖液中的核提取物一起溫育。核提取物中活性形式的轉(zhuǎn)錄因子與其共有序列結(jié)合。然后將寡蛋白復(fù)合物捕獲到測(cè)定微孔上。靶蛋白可以通過高親和力抗體識(shí)別,并通過檢測(cè)抗體 - 顯色試劑反應(yīng)系統(tǒng)進(jìn)行比色測(cè)量。
產(chǎn)品特點(diǎn)與優(yōu)勢(shì):
Nature文章發(fā)表結(jié)果:
《Klengel, Torsten, et al. "Allele-specific FKBP5 DNA demethylation mediates gene–childhood trauma interactions." Nature neuroscience 16.1 (2013): 33.》
rs1360780基因的A/G等位基因與TBP的結(jié)合能力分析,A等位基因的親和力明顯高于G.
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Hekmat-Scafe DS et. al. (November 2016). Using yeast to determine the functional consequences of mutations in the human p53 tumor suppressor gene: An introductory course-based undergraduate research experience in molecular and cell biology.Biochem Mol Biol Educ.
Jang JY et. al. (February 2016). Targeting adenine nucleotide translocase-2 (ANT2) to overcome resistance to epidermal growth factor receptor tyrosine kinase inhibitor in non-small cell lung cancer. Mol Cancer Ther.
Koh J et. al. (October 2015). EML4-ALK enhances programmed cell death-ligand 1 expression in pulmonary adenocarcinoma via hypoxia-inducible factor (HIF)-1α and STAT3 OncoImmunology.
Gao Y The Univer et. al. (June 2014). Up-regulation of Hepatic VLDLR via PPARα Is Required for the Triglyceride-Lowering Effect of Fenofibrate. J Lipid Res.
* 通用蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合分析試劑盒說(shuō)明書:點(diǎn)擊下載
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