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血液基因組DNA中提試劑盒的操作步驟描述
一、實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
- 試劑與耗材
- 檢查試劑盒組分:裂解液(Buffer AL/BL)、洗滌液(Buffer AW1/AW2)、洗脫液(Buffer AE)、蛋白酶K、吸附柱、收集管等。
- 自備物品:無(wú)水乙醇(如需添加到洗滌液中)、離心機(jī)、移液器、1.5mL離心管、渦旋振蕩器、水浴鍋(或金屬浴)。
- 樣本處理
- 使用EDTA抗凝全血,確保樣本未溶血。若樣本量不足,可用生理鹽水或PBS稀釋至推薦體積(如200-500μL)。
二、詳細(xì)操作步驟
步驟1:紅細(xì)胞裂解(可選,視試劑盒設(shè)計(jì)而定)
- 目的:去除紅細(xì)胞,保留白細(xì)胞核。
- 操作:
- 將全血樣本轉(zhuǎn)移至15mL離心管,加入3-5倍體積的紅細(xì)胞裂解液(如Buffer EL)。
- 顛倒混勻后,室溫靜置5-10分鐘,期間輕彈管底以促進(jìn)裂解。
- 2000×g離心5分鐘,棄上清(含裂解的紅細(xì)胞)。
- 重復(fù)上述步驟直至沉淀呈白色(白細(xì)胞團(tuán)塊)。
步驟2:細(xì)胞裂解與DNA釋放
- 目的:裂解白細(xì)胞,釋放基因組DNA。
- 操作:
- 向白細(xì)胞沉淀中加入200μL Buffer AL(含蛋白酶K),渦旋振蕩15秒。
- 56℃水浴孵育10-30分鐘(或根據(jù)試劑盒要求),期間每隔5分鐘渦旋一次。
- 孵育后短暫離心,使管蓋液體回落。
步驟3:DNA結(jié)合至吸附柱
- 目的:將DNA吸附到硅膠膜上。
- 操作:
- 向裂解液中加入200μL無(wú)水乙醇,渦旋混勻(若試劑盒已預(yù)加乙醇,則跳過(guò)此步)。
- 將混合液轉(zhuǎn)移至吸附柱(置于2mL收集管中),8000×g離心1分鐘。
- 棄收集管中廢液,將吸附柱放回原收集管。
步驟4:洗滌純化DNA
- 目的:去除蛋白質(zhì)、鹽分等雜質(zhì)。
- 操作:
- 向吸附柱中加入500μL Buffer AW1,8000×g離心1分鐘,棄廢液。
- 加入500μL Buffer AW2(含乙醇),14000×g離心3分鐘,去除殘留乙醇。
- 重復(fù)離心一次(空管),確保吸附柱干燥。
步驟5:DNA洗脫與收集
- 目的:將純化的DNA從吸附柱上洗脫。
- 操作:
- 將吸附柱轉(zhuǎn)移至新的1.5mL離心管,向膜中央加入100-200μL預(yù)熱至65℃的Buffer AE。
- 室溫靜置5分鐘,8000×g離心1分鐘。
- 可選擇重復(fù)洗脫一次以提高回收率(將洗脫液重新加入吸附柱,再次離心)。
三、關(guān)鍵注意事項(xiàng)
- 溫度控制
- 蛋白酶K裂解步驟需在56℃進(jìn)行,溫度過(guò)低會(huì)導(dǎo)致裂解不完全。
- 洗脫液預(yù)熱至65℃可提高DNA洗脫效率。
- 乙醇添加
- 若洗滌液需自行添加乙醇,務(wù)必使用無(wú)水乙醇,并確保終濃度符合試劑盒要求。
- 離心條件
- 離心速度和時(shí)間需嚴(yán)格遵循說(shuō)明書,避免DNA斷裂或吸附不完全。
- 避免污染
- 所有操作應(yīng)在無(wú)菌條件下進(jìn)行,使用無(wú)DNA酶的耗材和移液器吸頭。
四、結(jié)果評(píng)估
- 濃度與純度:使用分光光度計(jì)測(cè)定DNA濃度(A260)和純度(A260/A280=1.8-2.0)。
- 完整性:通過(guò)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA條帶(主帶應(yīng)集中于基因組DNA大小區(qū)域)。
五、常見問題與解決方案
問題 | 可能原因 | 解決方案 |
---|---|---|
DNA濃度低 | 樣本量不足或裂解不完全 | 增加樣本量,延長(zhǎng)裂解時(shí)間 |
A260/A280比值異常 | 蛋白質(zhì)污染 | 增加洗滌次數(shù),確保乙醇去除 |
DNA降解 | 操作粗暴或反復(fù)凍融 | 輕柔操作,分裝保存于-20℃ |
通過(guò)以上步驟,可高效提取高質(zhì)量基因組DNA,適用于PCR、測(cè)序、Southern blot等下游實(shí)驗(yàn)。不同試劑盒的具體操作細(xì)節(jié)可能略有差異,務(wù)必參考對(duì)應(yīng)說(shuō)明書。