小分子藥物靶點(diǎn)鑒定及驗(yàn)證檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹

現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)過(guò)程中，藥物靶點(diǎn)和作用方式仍然是zuì大的兩個(gè)挑戰(zhàn)。正確的藥物作用靶點(diǎn)不僅關(guān)系到藥物的效力和特異性，還涉及到藥物安全性和潛在的副作用問(wèn)題。藥物靶點(diǎn)是指藥物與機(jī)體內(nèi)生物大分子的直接結(jié)合部位，主要包括受體、酶、離子通道、轉(zhuǎn)運(yùn)體、核酸等生物大分子。鑒定藥物作用的靶點(diǎn)對(duì)于新藥的設(shè)計(jì)極為關(guān)鍵，它可以幫助我們理解藥物的作用機(jī)理，建立藥物活性與生物學(xué)功能之間的聯(lián)系，預(yù)測(cè)可能的副作用和耐藥機(jī)制，以及發(fā)現(xiàn)新的治療靶點(diǎn)。通過(guò)靶點(diǎn)鑒定，可以確保藥物研發(fā)過(guò)程的高效性和藥物上市后的安全性。

新的藥物作用靶點(diǎn)是一系列新藥發(fā)現(xiàn)的突破口，尋找藥物作用的新靶點(diǎn)已成為當(dāng)今創(chuàng)新藥研發(fā)激烈競(jìng)爭(zhēng)的焦點(diǎn)。從藥物開(kāi)發(fā)角度來(lái)看，藥物的效果很大程度上取決于它的作用靶點(diǎn)。目前主要使用兩種藥物發(fā)現(xiàn)策略：基于表型的藥物發(fā)現(xiàn)和基于靶標(biāo)的藥物發(fā)現(xiàn)?；诒硇偷乃幬锇l(fā)現(xiàn)根據(jù)現(xiàn)有的藥理學(xué)，在細(xì)胞、組織或器官中篩選小分子或多肽。基于靶標(biāo)的藥物發(fā)現(xiàn)首先涉及確定靶標(biāo)，然后識(shí)別活性分子。隨著分子生物學(xué)的快速發(fā)展，基于靶標(biāo)的藥物發(fā)現(xiàn)范式取代了傳統(tǒng)的基于表型的方法，因?yàn)樗梢蕴岣吆Y選能力并定義合理的藥物發(fā)現(xiàn)方案。

酶作為藥物靶點(diǎn)

百泰派克生物科技（BTP）依托高分辨質(zhì)譜平臺(tái)，結(jié)合親和層析技術(shù)以及活性位點(diǎn)定向探針技術(shù)，開(kāi)發(fā)并驗(yàn)證了多種基于靶標(biāo)的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定平臺(tái)，為您提供分子間相互作用鑒定全流程科研服務(wù)，包括蛋白-蛋白互作（PPI）、蛋白-小分子藥物互作，可以準(zhǔn)確地識(shí)別和驗(yàn)證小分子藥物的作用靶點(diǎn)，助力創(chuàng)新藥物的發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)。百泰派克生物科技基于靶標(biāo)的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定方案包括：

1.基于ABPP策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定及驗(yàn)證

基于活性的蛋白質(zhì)分析（Activity-based protein profiling，ABPP）將基于活性的探針和蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)結(jié)合在一起，用于識(shí)別小分子的蛋白質(zhì)靶標(biāo)，甚至靶蛋白的活性位點(diǎn)。ABPP 利用由兩個(gè)元素組成的活性位點(diǎn)定向化學(xué)探針：1）活性位點(diǎn)定向反應(yīng)基團(tuán)，用于結(jié)合和共價(jià)標(biāo)記催化相關(guān)酶的特定子集（或家族），以及 2）報(bào)告標(biāo)簽（例如，熒光團(tuán)、shēngwùsù、炔烴或疊氮化物）用于檢測(cè)/定量和/或富集/鑒定標(biāo)記的酶。原則上，小分子的活性基團(tuán)直接與目標(biāo)蛋白和報(bào)告基團(tuán)相互作用，以利于目標(biāo)捕獲。根據(jù)所選的報(bào)告組，可以進(jìn)行不同的后續(xù)實(shí)驗(yàn)。例如，熒光基團(tuán)可用于快速凝膠篩選和鑒定細(xì)胞或動(dòng)物中小分子的定位，shēngwùsù可用于蛋白質(zhì)富集，然后通過(guò)質(zhì)譜檢測(cè)來(lái)鑒定目標(biāo)蛋白質(zhì)。

• Front Pharmacol. 2018 Apr 9;9:353.*

基于活性的蛋白質(zhì)分析工作流程

服務(wù)內(nèi)容

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1）特異性：通過(guò)特定活性探針針對(duì)性地標(biāo)記活躍的酶類，高度特異的識(shí)別活性蛋白質(zhì)；

2）功能性分析：能夠直接評(píng)估蛋白質(zhì)的酶活性狀態(tài)，而不僅是其表達(dá)量或結(jié)構(gòu)變化；

3）實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)：可以在細(xì)胞內(nèi)的生理?xiàng)l件下監(jiān)測(cè)酶的活性，捕捉藥物的即時(shí)影響；

4）非侵入性標(biāo)記：探針與蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)合是非侵入性的，不會(huì)干擾其正常功能，保持了生物樣品的生理真實(shí)性；

5）樣品適用性：ABPP技術(shù)可用于細(xì)胞裂解物、活細(xì)胞、動(dòng)物裂解物，甚至活體動(dòng)物。

2.基于策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定

熱蛋白質(zhì)組分析（Proteome-Wide Thermal Stability Profiling）旨在全面了解小分子化合物與蛋白質(zhì)的相互作用。其核心原理是基于一個(gè)事實(shí)：受熱時(shí)的蛋白質(zhì)會(huì)變性并變得不溶。蛋白質(zhì)可以在與小分子（例如藥物或代謝物）、核酸或其他蛋白質(zhì)相互作用或翻譯后修飾時(shí)改變其熱穩(wěn)定性。熱蛋白質(zhì)組分析使用基于多重定量質(zhì)譜的蛋白質(zhì)組學(xué)來(lái)監(jiān)測(cè)數(shù)千種表達(dá)蛋白質(zhì)的熔解曲線。重要的是，這種方法可以在體外、原位或體內(nèi)進(jìn)行。 熱蛋白質(zhì)組分析已成功應(yīng)用于識(shí)別藥物的靶標(biāo)和脫靶、研究蛋白質(zhì)-代謝物和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用、識(shí)別代謝物結(jié)合蛋白以及繪制與不同核苷酸相互作用的蛋白質(zhì)圖譜。

基于熱蛋白質(zhì)組分析策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定工作流程

服務(wù)內(nèi)容

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1）全局性和非偏倚性：可以在全蛋白組水平上，無(wú)偏倚地探索小分子與蛋白質(zhì)的相互作用；

2）細(xì)胞內(nèi)作用分析：可在細(xì)胞的生理環(huán)境中捕捉真實(shí)的藥物-蛋白質(zhì)相互作用，反映藥物的實(shí)際作用；

3）定量性：可提供關(guān)于藥物-靶標(biāo)相互作用強(qiáng)度和穩(wěn)定性的定量信息；

4）數(shù)據(jù)可靠性：熱蛋白質(zhì)組分析可以同時(shí)在多個(gè)溫度點(diǎn)上進(jìn)行，因此可以減少因?qū)嶒?yàn)設(shè)置導(dǎo)致的偏差，提高數(shù)據(jù)的可重復(fù)性和可靠性。

3.基于LiP-MS策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定

限制性酶解-質(zhì)譜分析（Limited Proteolysis-Mass Spectrometry，LiP-MS）結(jié)合蛋白質(zhì)限制性酶解和質(zhì)譜分析的技術(shù)，利用特定條件下蛋白酶對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行有限度的切割生成的蛋白片段進(jìn)一步通過(guò)質(zhì)譜分析鑒定。在小分子藥物靶點(diǎn)鑒定過(guò)程中，將小分子藥物與其潛在的蛋白質(zhì)靶點(diǎn)進(jìn)行孵育，藥物分子與蛋白質(zhì)結(jié)合后會(huì)引起蛋白質(zhì)構(gòu)象的改變，這種改變會(huì)影響到蛋白質(zhì)的酶解模式。通過(guò)比較藥物處理和未處理?xiàng)l件下蛋白質(zhì)的酶解片段，可以識(shí)別出與藥物相互作用的蛋白質(zhì)區(qū)域，進(jìn)而推斷出藥物的作用靶點(diǎn)。這對(duì)于藥物機(jī)制的解析和新藥發(fā)現(xiàn)具有極其重要的意義，尤其是在有針對(duì)性地設(shè)計(jì)藥物分子和優(yōu)化藥物效能方面。

基于LiP-MS策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定工作流程

服務(wù)內(nèi)容

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1）高通量和高靈敏度：LiP-MS能夠分析數(shù)千個(gè)蛋白質(zhì)樣本，即使是那些低豐度的蛋白質(zhì)靶標(biāo)也能被鑒定出來(lái)；

2）無(wú)需先驗(yàn)知識(shí)：這種方法不需要關(guān)于潛在靶點(diǎn)的預(yù)先信息，可以在廣泛的蛋白質(zhì)中發(fā)現(xiàn)未知的藥物作用點(diǎn)；

3）體外和體內(nèi)適用性：LiP-MS既可以在體外進(jìn)行，也可以在體內(nèi)應(yīng)用，可提供更多關(guān)于藥物如何與靶標(biāo)相互作用的信息；

4）結(jié)構(gòu)動(dòng)態(tài)性分析：LiP-MS可以提供小分子與蛋白質(zhì)結(jié)合后蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)變化的動(dòng)態(tài)過(guò)程。

4.基于DARTS策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定

藥物親和致靶點(diǎn)穩(wěn)定性（Drug affinity responsive target stability，DARTS）是一種識(shí)別小分子的潛在蛋白質(zhì)靶點(diǎn)相對(duì)快速且直接的方法，它依賴于通過(guò)與小分子相互作用而賦予靶蛋白免于蛋白水解的保護(hù)。DARTS 通過(guò)簡(jiǎn)單地用感興趣的化合物和載體對(duì)照或無(wú)活性類似物處理細(xì)胞裂解物的等分試樣，然后用蛋白酶對(duì)細(xì)胞裂解物中的蛋白質(zhì)進(jìn)行有限消化來(lái)進(jìn)行。然后通過(guò) SDS-PAGE 分離樣品并染色，以鑒定免受小分子蛋白水解的蛋白質(zhì)條帶。zuì后使用質(zhì)譜 （MS） 來(lái)鑒定每個(gè)條帶中存在的蛋白質(zhì)。這種無(wú)偏見(jiàn)的方法已成功用于識(shí)別天然產(chǎn)物和其他生物活性小分子的新蛋白質(zhì)靶標(biāo)。

基于DARTS策略的小分子藥物靶點(diǎn)鑒定工作流程

服務(wù)內(nèi)容

技術(shù)優(yōu)勢(shì)

1）非標(biāo)記性：DARTSzuì大優(yōu)點(diǎn)是能夠使用天然小分子，而無(wú)需對(duì)藥物或蛋白進(jìn)行固定或修飾（例如，摻入shēngwùsù、熒光、放射性同位素），從而避免可能影響藥物活性或蛋白結(jié)構(gòu)的問(wèn)題；

2）直接性：可以直接在復(fù)雜的生物樣本中進(jìn)行，不需要純化蛋白，使得數(shù)據(jù)更接近生理狀態(tài)；

3）保真性：能夠保留藥物與其潛在靶標(biāo)的生理相互作用，提供更加真實(shí)的藥物-靶標(biāo)相互作用信息；

4）適用性廣：可以用于任何類型的小分子藥物，不論其化學(xué)性質(zhì)如何，已廣泛應(yīng)用于追蹤來(lái)自動(dòng)物、真菌、細(xì)菌和植物的蛋白質(zhì)；

5）時(shí)效性和經(jīng)濟(jì)性：實(shí)驗(yàn)步驟相對(duì)簡(jiǎn)單快捷，可以在較短的時(shí)間內(nèi)獲得結(jié)果，且不需要昂貴的設(shè)備和試劑，更為經(jīng)濟(jì)。

應(yīng)用案例

1.采用ABPP技術(shù)鑒定抗糖尿病藥物-èrjiǎshuāngguā的直接作用靶點(diǎn)：

通過(guò)èrjiǎshuāngguā探針鑒定èrjiǎshuāngguā相互作用蛋白

利用質(zhì)譜法測(cè)定PEN2與èrjiǎshuāngguā的結(jié)合位點(diǎn)，再通過(guò)SPR分析其與èrjiǎshuāngguā的相互作用

2.通過(guò)細(xì)胞表面熱蛋白質(zhì)組分析全面表征配體誘導(dǎo)的質(zhì)膜蛋白質(zhì)豐度和熱穩(wěn)定性變化以研究藥物與細(xì)胞外受體和轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的結(jié)合：

3.使用 LiP-MS 篩選腦脊液中與衰老相關(guān)的新型蛋白質(zhì)和復(fù)合物：

4.利用DARTS技術(shù)揭示細(xì)絲蛋白為抗癌黃酮類藥物qīng hāo sù的生物靶點(diǎn):

相關(guān)服務(wù)

PROTAC藥物脫靶分析

蛋白質(zhì)相互作用質(zhì)譜分析

免疫共沉淀法（CO-IP）結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

GST融合蛋白Pull-down技術(shù)結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

SILAC與免疫共沉淀結(jié)合質(zhì)譜聯(lián)用的蛋白互作分析

百泰派克生物科技特色項(xiàng)目

一、蛋白測(cè)序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測(cè)序系統(tǒng)對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行分析，提供基于質(zhì)譜的蛋白測(cè)序分析服務(wù)，包括對(duì)蛋白質(zhì)的氨基酸組成分析，N端測(cè)序，C端測(cè)序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白質(zhì)N端序列分析服務(wù)。對(duì)于未知理論序列的蛋白質(zhì)，提供基于從頭測(cè)序法的蛋白質(zhì)從頭測(cè)序服務(wù)，對(duì)蛋白序列進(jìn)行分析。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實(shí)現(xiàn)對(duì)所測(cè)定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測(cè)定蛋白N端多達(dá) 70個(gè)氨基酸序列;

4.可測(cè)定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測(cè);

6.測(cè)序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。

二、蛋白質(zhì)組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺(tái)結(jié)合Nano-LC，提供定量蛋白質(zhì)組學(xué)、靶向蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種蛋白質(zhì)組學(xué)分析服務(wù)。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白質(zhì)組學(xué)服務(wù)，助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1 .高通量定量蛋白分析:多對(duì)照組大規(guī)模實(shí)驗(yàn)分析，發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種蛋白質(zhì)標(biāo)記方法，適用于分析組織、細(xì)胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高，實(shí)驗(yàn)結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測(cè)較低豐度蛋白，線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析，分析更系統(tǒng)準(zhǔn)確。

三、單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進(jìn)行單細(xì)胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析，采用金屬元素標(biāo)記物（通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體）標(biāo)記細(xì)胞表面和內(nèi)部的分子，然后用流式細(xì)胞原理分離單個(gè)細(xì)胞，再用電感耦合等離子體質(zhì)譜（ICP-MS）分析單個(gè)細(xì)胞的原子質(zhì)量譜，zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細(xì)胞表面和內(nèi)部的信號(hào)分子表達(dá)量。

※服務(wù)優(yōu)勢(shì)：

1.技術(shù)優(yōu)良，*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù)，避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問(wèn)題?？稍趩渭?xì)胞層面上對(duì)多種指標(biāo)同時(shí)進(jìn)行表征，百泰派克生物科技可做到同時(shí)檢測(cè)51個(gè)目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大，成本較低

單細(xì)胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細(xì)胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個(gè)左右，而流式質(zhì)譜技術(shù)一次（單樣本）就可分析至少10^5的細(xì)胞，實(shí)現(xiàn)了數(shù)量級(jí)的提高，且成本不高于單細(xì)胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細(xì)胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機(jī)制研究等方面具有極大的研究前景；

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會(huì)有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外，質(zhì)譜流式細(xì)胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾；

③可檢測(cè)細(xì)胞存活率、細(xì)胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達(dá)量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實(shí)現(xiàn)10,000個(gè)以上I型多肽和10,000個(gè)以上II型多肽的鑒定和識(shí)別。通過(guò)我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺(tái)進(jìn)行免疫肽組學(xué)分析，可從zuì小的樣品材料中進(jìn)行可重復(fù)的識(shí)別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標(biāo)。

五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù)，MALDI TOF，高效色譜分離技術(shù)，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從蛋白質(zhì)、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級(jí)結(jié)構(gòu)分析，到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù)，幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。

百泰派克生物科技七大檢測(cè)平臺(tái)

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測(cè)和項(xiàng)目驗(yàn)證等zhuānyè服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則，通過(guò)CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認(rèn)證，建立了完備的質(zhì)量體系，數(shù)據(jù)冷熱/異地備份，設(shè)備定期計(jì)量/期間核查，軟件審計(jì)追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù)，支持新藥研發(fā)、藥物申報(bào)注冊(cè)和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系，zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測(cè)分析服務(wù)；

2.獲國(guó)家CNAS實(shí)驗(yàn)室認(rèn)可，為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù)；

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋蛋白質(zhì)組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細(xì)胞分析、單細(xì)胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等；

4.七大質(zhì)量控制檢測(cè)平臺(tái)，滿足您一站式服務(wù)需求；

5.服務(wù)3000+企業(yè)，10000+客戶的選擇；

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!

小分子藥物靶點(diǎn)鑒定及驗(yàn)證檢測(cè)技術(shù)服務(wù)詳情介紹